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（一）流式细胞分离仪分离法
利用X**和Y**中DNA含量的差异来分离**，X**和Y**DNA含量的差异为3－5％，分离准确率可以达到90％（Johnson and Welch,1999）。
这种技术在（大不列颠）联合王国已经被商业化并且运用到牛的生产中，分离好**的销售在2000年9月已经开始；在其他国家也逐渐开始形成商业化 。
流式细胞分离仪分离法的不足之处
1 流式细胞分离仪的价位昂贵，约为$300，000 ；
2 如果操作不当后代畸形的出现将无法控制；
3 每秒分离5000－6000个**的速度已经相当快了，但是相对于牛人工授精所需要的最小**剂量10^6个来说还是很慢的。
4 **在分离过程中还经历了机械和化学应激对**不利（Garner et al, 2001）
（1）**与DNA结合染料Hoechst33342接触，肯定会把少量的染料带入到胚胎中；
（2）测定DNA含量时，**暴露在激光的电磁能和发射的荧光下；
（3）**以90km/h的速度离开分离仪管口，并且毫无缓冲；
（4）当**进入收集管中时，在气体与液体的接触界面，突然从90km/h的速度转为0；
（5）当从液流中把**转为一滴时，对**产生拉伸作用；
（6）分离后的加工过程如离心和浓缩过程(Schenk et al，1999)。最近研究表明在流式细胞分离系统中把压力从50psi降低到40psi可以显著降低对**的伤害（Suh and Schenk, 2003）。
（二）利用免疫学方法分离**
Blecher等（1999）报道的免疫学方法。这种方法是在基础生物学研究中发现的 ，通过分离X丶Y**表面差异膜蛋白后，通过抗原抗体反应到达分离某一类**的目的。然而，这种方法到现在也没有被广泛应用。
（三）干涉显微镜下 分离X丶Y**
Munster et al（1999）报道的。其原理是在干涉显微镜下可以看到单个**的体积大小不一。他们十分肯定的说，牛携带X染色体的**比携带Y染色体的**大约大1％。这种技术已经完全自动化，因此可以大量分离**。但是这种方法是否能够分离出大量的具有正常受精能力的**仍不清楚。这种方法的优点是不用DNA结合染料，缺点是分离出的X**和Y**的准确率在80％以下，甚至有可能更低，因为生物学的差异远远大于1％（Van Munster et al ,1999）。因此，在生产中应用受到限制。
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